国本之争的深远影响：从明神宗的怠政到朝局混乱
国本之争对万历时期产生了极为深远的影响，首先是皇权事实上大幅度下降。明神宗长期不理朝政，使得内阁、地方官员缺位，这导致晚明政治运行出现严重障碍。而他又大兴敛财，派出矿监、税监，对百姓造成巨大的苦难，从而激发了民变。这一系列事件直接影响到了社会稳定和国家治理。
其次，国本之争也促进了党派斗争的形成。由于明神宗对于储位模糊不清，使得官场及地方人士开始猜测和揣摩，这种情况加剧了政局的混乱。在这样的环境中，五大党（宣、大/昆山、齐洲、楚江浙）与东林两大党之间不断进行暗斗，最终演化成了一场声势浩大的政治斗争，这种状况严重削弱了政府行政效率，并成为后来的三大案件诱因之一。
再者，由于希望独揽大权，同时放任缺官现象未被解决，内阁力量自然受到削弱。同时，由于长时间居住在深宫中，不理朝政，司礼监的地位随之提升；外戚实力得到发展，而出现内监以郑贵妃为主的情况。此时言官因为对朝政不满，上疏抨击，更是地位提高。
当时皇帝怠政且昏庸无道，与廷臣间的攻讦与指责使得政府机构变得松散。而言官通过批评朝政，在维护正统原则、稳定秩序以及制衡皇权方面发挥重要作用。在这种纷扰多年的斗争过程中，言官群体成为维护国家稳定的关键力量之一。
“国本之争”最终决定了万历以后明朝走向，也加剧了晚明党派冲突，并在一定程度上加速了明朝灭亡的一步，是晚 明历史上最具影响力的事件之一。然而，对于这个主题，有许多学者仍然站在支持或反对郑贵妃角色的立场，他们往往基于僵化保守的人云亦云观点，没有给予公正评价，为这段历史添加了一层难以消除的情感色彩。
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