新疆这块地方，自唐朝之后就没有再受到过中原王朝的统治，长时间处于一种无休止的混战状态。其实，在明朝前期，大明西边也有一部分疆土是属于新疆的，就像哈密，它就是继承了元朝时候剩余的西面领土，还有哈喇火州地区，但是，以西地区还是处于动荡之中。
“封疆之狱”对于明朝来说是一个比较重大的事件，这个事件算是明朝对新疆部分地区控制的一个分水岭。嘉靖初年之时，土鲁番多次兴兵攻扰肃州等地，此时的明廷内部因大礼议之争，就收复哈密事掀起了“封疆之狱”，处置了甘肃巡抚陈九畴等四十余人后，明世宗朱厚熜采用了几位大臣的建议，开始起用王琼。
嘉靖七年，朱厚熜又将原三边总督王宪任为南京兵部尚书，使其得以参与军机大事的讨论。而王琼则被提为三边总督，代替了王宪的位置。此时，那些通过“封疆之狱”而晋升高位的官员，对明朝西北边境的问题没什么兴趣，因为他们更关心的是自己的政治生涯和权力斗争，而不是真正解决国家问题。
然而，有着深刻洞察力的许论，他对之前与吐鲁番议和的事项有过委婉批评。他认为要想收复哈密并不简单，因为它是一个多次失守的地方，其战略价值已经不如以前重要，而且那些遗民已经繁衍出新的生活方式，对回归故土兴趣不大。同时，他们还担忧如果急于收复哈密，那么可能会成为敌人的筹码，从而影响到整个国家的情势稳定性。
尽管如此，由于这些原因，以及其他一些不可预见的情况，最终导致了一种局面的形成：哈密及其周边区域虽然未能完全恢复，但却进入了一段相对较为平稳的小小安宁期。在这一过程中，即使吐鲁番成为了一个强大的力量，却依然保持着向东方各国进贡，并且确保自己在这个过程中的主导地位，这种局面一直持续到了哈密衰落后才发生改变。
历史往往充满了意料之外的事情，让我们难以捉摸其背后的真相。
