在中国历史上，明朝几个时期都曾经有所设立南京为都。这种选择主要基于政治、经济和战略因素，这里我们将探讨这一过程中的关键点。
首先，明太祖朱元璋即位后，将首都定位于南京。这一决策背后是对北方战乱地区的担忧以及希望通过集中力量统一全国的战略考虑。南京地处长江下游，是一个自然屏障，同时也便于控制江淮地区，对抗蒙古等外患。
其次，洪武年间，为了加强中央集权和巩固新政权，朱元璋实施了一系列改革措施之一，就是从北京迁都至南京。在此期间，他还进行了大规模的城市建设，如修建了紫禁城、故宫等重要建筑物，使得南京成为一个繁华富饶的大都市。
再者，在嘉靖年间，由于北京遭受火星灾害严重，加之朝廷内部斗争激烈，皇帝开始重新考虑使用宁波作为临时首都是可能性的地方。但最终并未实行，因为宁波地理位置不利于统治全国。
接着，在崇祯年间，由于战争连绵不断尤其是与李自成领导的农民起义（称为“大顺”）爆发之后，因北方失守而使得北京被攻陷，因此崇祯帝不得不返回到原来的旧都——南京继续抵抗敌军，但最终还是失败了，最终导致清朝入主中原。
最后，在三藩之乱结束后，即康熙初年，由于清朝需要稳定国家局势，并且想要减少来自内陆省份对边疆政策影响，因此决定将首都由山海之间的地理位置转移到更为中央偏北方的地方，即今天的北京，从而完成了从明到清两代政府对于首都是多次变化的一段历史。
总结来说，每一次改变都会反映出当时社会政治经济环境及国家安全形势所面临的问题，以及各个皇帝对于如何维护中央集权和应对外部威胁的手段。
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