国本之争的深远影响：从明神宗的怠政到朝局混乱
国本之争不仅对万历时期产生了深远的影响，还直接导致了皇权事实上的下降。明神宗在位期间，忽视朝政，长时间不理国家大事，这造成了内阁、地方官员缺乏有效领导，使得晚明正常运作受到极大的破坏。他还实施敛财政策，派遣矿监和税监，对百姓造成巨大苦难，最终激发民变。
此外，国本之争也是形成党争重要原因之一。由于明神宗对于储位模糊，不确定自己的继承人，使得官场中的人物开始猜忌和揣测，从而引起政治局势混乱。在这过程中，出现了五大党派（宣、大、昆、齐、楚浙）以及东林党与阉党之间的斗争，这种情况加剧了政府行政效率的下降，并成为三大案件诱因之一。
同时，由于明神宗希望独揽大权，却又放任缺官现象未解决，使得内阁势力被削弱；司礼监因为拥有批红文件权限，在这种特殊环境下地位上升。而郑贵妃的地位提升，也让外戚势力得到发展，加上内监以郑贵妃为主导的情况发生。
当时皇帝怠政且昏庸无道，廷臣之间不断攻讦和斗争，同时政府机构也变得涣散。言官们通过疏状抨击朝政，不满的声音越来越高涨，他们也因此获得了一定的实力；地方士绅则不再将仕途作为衡量生活价值唯一标准，而是有了一些新的选择，如“山人”群体等。此后，又有东林书院文人关注时政，最终演化成东林党。
在这几十年的斗争中，言官们以集体行动维护正统皇位继承原则、稳定统治秩序并制衡皇权，以及弘扬官方正气发挥着极其重要作用。“国本之争”，决定了万历之后清晰可见的是，一方面它促成了晚明三大案件的一系列事件，即使这些事件最终加速了整个朝代走向灭亡，它依然是历史上最具影响力的事件之一。
关于这一主题，有许多学者仍然站在万历一朝臣僚这一边，为此提出了不同的观点。他们似乎认为郑贵妃天生就应该安分守己，而不是追求更高的地位；而万历皇帝同样应当专心王恭妃，与爱情无缘。但这些论断基于一种僵化保守思想，没有给予公平评价，让原本复杂多变的历史再次蒙上了难以识别的阴影。
