朱棣的登基标志着明朝进入了一个新的高峰期，但他的统治也埋下了日后王朝衰败的种子。明朝在发展过程中有一套特殊且顽强的运作体系，朱棣在位22年，他既有所成也有过失，其后来的皇帝很难完全超越他。
一、宦官之权
朱元璋对宦官的权力进行严格约束，以防止宦官干预政事。他规定宦官不得兼任文武职务，不能超过四品，不得查阅公文，并刻有“内臣不得干预政事，预者斩”铁牌作为国策。但这些措施最终被废除。
二、京城守卫
为了抵御北方威胁，朱棣亲征并修筑紫禁城，将都城迁至北京。这一战略调整有效地削弱了边境威胁，但迁都带来了人口增长和物资运输问题。此举也为后来的皇帝树立了不易迁都的心理障碍。
三、藩王待遇
尽管是由朱元璋设立，但他没有解决藩王制度的问题，而是使其更为复杂。改革后，藩王失去了兵权，却获得更好的待遇。在缺乏杂交水稻技术的情况下，这样的待遇导致宗室人口迅速增加，最终成为国家财政负担，使大明王朝走向灭亡。
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