任何一个朝代的灭亡，原因无外乎天灾人祸，明末的天灾小冰河期谁都知道不用说，人祸一方面是鞑子，但是鞑子只是外因表象，不起决定性作用，外因通过内因起作用，内因是什么？一切原因归根结底还是人——官员，一切问题的源头。我们要从两个层面来分析：财政和藩王。
首先，从财政角度看，大一统封建王朝最重要的收入来源是什么？是盐税，这个国家垄断暴利盐税占了清朝大部分收入比例。明朝呢？盐价远比两朝高，但盐税收入连两朝的一半都没有。这主要是因为流失的盐税催生出一大批富可敌国的盐商，所以归根结底还是官员的问题。
其次，从藩王制度来看，当时有20多万宗室需要国家维持，而国家财政收入不足以支付这笔费用，更不要说那些不交税士绅了。其实，明朝开国就先天不足，由于朱元璋本身文化水平低下，没有长远眼光去制定政策治理国家，这注定了后来的结果，比如藩王之乱、推恩令等问题。
再者，从教育和科举制度来说，当时的人们全心琢磨四书五经，没有产生像样的人才。而科举系统导致了僵化思维，不利于新思想、新学科乃至自然科学发展。从中唐、大怂到明朝，再到清 朝，每个时代人的思维都越来越僵化。
最后，我们可以认为这是中国文明缺乏启蒙者的结果。在百家争鸣时代，没有出现像亚里士多德这样的启蒙者，使得所有讨论都是如何治人的法子，而不是深入思考理性思维。这也是中华文明的一个重要缺失。
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