政治腐败与中央集权的缺失
在明朝初期，朱元璋通过严苛的法规和残酷的手段巩固了自己的统治，但随着时间的推移，他对手下官员的一系列猜忌和不必要的清洗导致了政治体系中的空洞。许多重要职位空缺，而那些填补这些职位的人往往是因为他们与皇帝有亲缘关系或者能够提供一些实际帮助而非真正具备能力。这种中央集权下的权力分散，使得地方上的督抚、总兵等高级官员几乎拥有独立王国般的地位，这直接导致了地方主义盛行。
经济衰退与农业生产问题
明朝中后期，由于地主阶级对农民土地占有的过度扩张，农民负担加重，加上天灾人祸频发，如洪水、干旱以及瘟疫等自然灾害，农业生产出现长期低迷。这导致粮食供应紧张，从而引起社会矛盾激化，并且进一步加剧了经济衰退的问题。同时，由于贸易路线受阻，尤其是海上贸易受到倭寇侵扰，外国货物进口减少，也给经济发展造成了不利影响。
文化衰落与学术界分裂
在文化领域，明末学术界出现了一种极端个人主义思想，即“心学”这一流派代表人物王阳明提倡“知行合一”的原则，使得人们更多关注个人的道德修养，而忽视科学研究和实用技术。在此背景下，对古代典籍的解读变得越来越主观性强，以至于形成了一种浮夸之词、虚无缥缈的情感表现所谓“文言文学”的繁荣也使得文章内容多为辞藻华丽却内容浅薄。
军事上的失败与边疆安全危机
军事方面，由于长时间内没有有效的大规模战争训练及现代化建设，因此当面临外部威胁时，如李自成领导的大顺军或其他反满清运动时，其军队战斗力显著不足。而边疆地区如蒙古、新疆等地由於長年來以貿易為主導，不太注重軍事建設，所以當遇到邊患時處理不善，這些都让明朝防御能力大打折扣，最终无法抵挡来自各方敌人的冲击。
社会动荡与百姓生活水平下降
社会动荡主要体现在农民起义频发，这些起义从小规模开始逐渐演变成为大的武装力量，最终威胁到了整个国家政权稳定。由于连年的战乱和政府政策失误，加之经济困难和自然灾害频发，大批百姓陷入贫困，他们生活水平不断下降。此外，一些贪官污吏滥用公款、私吞国资，为自己积累巨额财富，同时进一步恶化人民群众的心理状态。
