国内外军事压力加剧
元朝在国内外面临着严重的军事压力，尤其是蒙古族内部的分裂和部落矛盾、以及来自明清等民族的持续进攻。从1356年起，朱元璋领导的一支农民起义逐渐发展壮大，最终建立了明朝，这对元朝造成了巨大的威胁。此外，从1370年代开始，金国残余势力不断侵扰元境，加上察罕帖木儿等南北边疆的叛乱，更是给予了元政府沉重打击。这些内部矛盾和外患共同作用，使得元朝难以为继。
经济社会危机深化
元朝末年经济社会问题日益突出。首先，在农业方面，由于连年的战乱导致土地荒废，大量人口流离失所，农业生产受到了严重破坏。此外，由于长期战争引发的人口减少和劳动力的短缺，使得粮食供应紧张，不断发生饥荒。在商业领域，货币贬值、通货膨胀等问题频发，对商人阶级产生了极大的影响。而文化教育方面，也出现了知识产权保护不到位、学术思想封闭僵化的问题，这些都对整个社会稳定构成了挑战。
政治腐败与中央集权弱化
元朝晚期政治腐败现象普遍存在。皇帝多次下诏纠正，但实际效果不彰。这一时期的宦官专权更是削弱了君主地位，而中央集权则因地方割据而变得脆弱。在地方行政管理中，以忽必烈时期设立的地方官员制度虽然初衷好，但是随后却演变成了一种形式主义，有利于一些地方豪强维护自己的特权，从而进一步削弱中央政府的实效控制能力。
社会结构冲突激化
随着时间推移，原来的草原游牧生活方式受到汉族地区传统文化及城市生活方式影响逐渐消失，而新的城镇经济与宗教信仰也在不断兴起。但这种快速变化带来了社会结构上的冲突，如牧民与农耕者之间、市民与贵族之间，以及不同民族间相互之间都存在着不同的利益诉求和价值观念差异，这些矛盾最终演变为不可调和的地理政治斗争。
文化交流断裂与科技落后
元代曾经繁荣昌盛，但随着时间推移，其文化交流断绝并未得到有效恢复。这使得原本丰富多彩的文化生态逐渐萎缩，同时科技创新也被束缚在传统框架之中，没有能够适应时代变化的情况下进行创新转型。此外，与其他国家特别是在东方世界中的竞争意识淡薄，加上没有形成有效的大规模科学技术研究体系，都为当时国家陷入困境埋下伏笔。
