元朝统治时期相对较短
元朝在1279年建立，至1368年被明军推翻，仅存在了约90年。这个时间段相比于其他大型帝国内部历史而言实在是太短暂了。这种短暂的统治使得元朝的历史不如唐宋那样深入人心，也影响了后世对其历史的记载和研究。
元朝文化与汉族文化冲突严重
元朝建立后，为了巩固自己的统治地位，不断推行蒙古化政策，这种政策导致了一系列与汉族文化冲突。例如，禁止使用汉字改用蒙古文字等措施，使得许多传统知识和学术成果无法得到有效记录和传承，从而减少了人们对于元代文化的兴趣。
元代文献资料损失严重
由于战争、自然灾害以及政治动荡等多种原因，大量关于元代的文献资料丢失或毁坏。在这期间，一些珍贵的手稿、书籍甚至整个图书馆都遭到了破坏，这些都是研究元代史料不可或缺的一部分，因此，对于了解这一时期的人文社会发展造成了极大的困难。
明清两代强烈排满情绪
明清两代对于前辈国家——宋王室及耶律楚材等人的崇拜非常浓厚，而对于由异族所建政权，如元 朝，则表现出了强烈排斥的情绪。这一情绪体现在文学作品中，即便有提到，但往往带有贬低性质，对于塑造正面形象起到了消极作用。
后世史家观点偏向性较强
在撰写中国历代史书时，由于各个时代背景不同，以及个人价值观念差异，很多史家会根据自身立场去选择或者忽略信息。特别是在近现代以来的民族主义思潮下，有一些史家将更多精力放在讨论“中华民族”的形成上，对于其他非主流思想和事实进行压制，使得元朝在当今社会中的知名度并不高。
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