政治腐败的深入蔓延
元朝后期，蒙古贵族之间的权力斗争日益激烈。忽必烈去世后，其子们为了争夺帝位，不断发生内讧。这不仅削弱了中央集权，还导致地方官吏和军队失去了对中央政府的忠诚。这种情况下，原本应该是国家利益所在的地方资源被贪婪地瓜分开来，最终导致了国家财政的大量流失。
种姓制度与社会矛盾
元朝实行严格的种姓制度，高级贵族拥有巨大的特权，而低等民族如汉人、苗人、回鹘等则处于极其不利的地位。这种长期存在的社会隔阂和歧视加剧了各民族间以及不同阶层之间的人民矛盾，使得社会内部出现了巨大的裂痕，这些裂痕最终演变成不可弥补的损伤。
经济危机与农业衰退
随着时间推移，元朝经济逐渐陷入困境。由于重农抑商政策导致农业生产停滞不前，同时贸易活动受到限制，加之连年战乱和自然灾害频发，农田荒废、人口减少，从而引起了粮食供应紧张的问题。此外，由于缺乏有效管理，一些重要商品价格上涨，大量人民生活水平下降。
军事力量锐减与边疆防御空虚
尽管元朝初期军事强大，但随着时间推移，因为战争消耗过大及国内问题不断，它们逐渐失去了原有的战斗力。此外，由于长期征服多个地区建立庞大的帝国边界，并非所有地区都能得到充分巩固，因此边疆防御空虚成为敌方侵扰的一个漏洞。在这个时候，如果没有足够强有力的防守措施，就容易被其他势力利用以达到自己的目的。
文化交流与信仰冲突
尽管在文化交流方面，有很多成果，如佛教、道教等宗教在中国传播，以及中亚、中东文化影响到中国，但是这些进程并未带来真正意义上的融合相反，由于信仰冲突，如藏传佛教对汉传佛教的一系列排斥行为，在某种程度上加剧了民族关系紧张。而且，当时西方文明开始进入亚洲，对当时已经动荡不安的亚洲造成了一定的震动。这一切都为最后关头留下了一定数量的心理准备工作。
