内忧外患
在内政方面，元朝内部存在着严重的问题。首先，政府官僚体制臃肿不堪，腐败现象普遍存在。中央集权制度下，一些地方官员为了维护自己的利益，不断侵蚀国家财政，使得国家的经济和财政状况不断恶化。此外，由于忽必烈等开国皇帝对蒙古族文化与汉族文化、回族文化等其他民族文化的融合处理得当，加上后来的汗王们对于各民族政策执行不力，导致了民族关系紧张，加剧了内乱。
军事衰弱
军事力量是任何一个帝国的重要支柱，但元朝却因为种种原因失去了这一优势。在军队组织结构上，由于长期战争消耗大量人力物资，而无法有效地进行军队整编和训练，使得军队战斗力大幅度下降。此外，对待异族士兵（如汉族、契丹、女真等）的政策也引发了一系列问题，比如他们的地位待遇不一致，这造成了士气低落，从而影响到了整个军队的战斗效率。
经济衰退
经济方面，也是元朝灭亡的一个重要原因。由于长期以来忽视农业生产，同时过分依赖畜牧业和贸易收入，导致粮食产量不足以满足人口需求，这直接导致了饥荒频发。而且，由于交通网络复杂且费用昂贵，对国内商品流通造成阻碍，加之对海外贸易受限，本来就脆弱的经济体系被进一步削弱。
政治混乱
政治上的混乱也是元朝灭亡的一个关键因素。在继承人选举上缺乏明确规则和稳定的传统，使得皇位争夺成为常态。这不仅加深了宫廷斗争，而且使得各个派系之间形成强烈对立，有时甚至会引起大的动荡事件。此外，即使是在战略决策层面，上述问题同样存在，如忽必烈虽然在开疆拓土方面取得巨大成就，但他的继任者并未能继续保持这种势头，而是陷入了一系列无谓的战争中浪费资源。
外患威胁
从外部环境看，在中国北方边境地区，察罕帖木儿领导下的瓦剌部落不断骚扰边境地区，并多次进攻北京城周围区域，这为后来清洗南京所需提供了有力的借口。而在西北边疆，则出现了黑死病疫情的大规模爆发，这极大地损害了当时社会生产力，并间接影响到国家税收来源，为后续再次抗击蒙古人的征讨埋下伏笔。
