国本之争的深远影响与元朝历史的社会反响
国本之争对元朝政局产生了深远的影响，首先是造成皇权事实上的下降。明神宗不理朝政，以至于最后对内阁、地方官员的缺官现象视而不见，给晚明的正常运行造成极大的破坏，而他又大兴敛财之道，派用的矿监、税监为害百姓，以致激起民变。其次，国本之争是使得晚明形成了党争的一个重要原因之一。明神宗对于储位的模糊态度，使得官场乃至地方的人妄加揣测，政局混乱，出现宣、昆、齐、楚、浙五党和东林党两大派明争暗斗，这种局面自然使得政府的行政效率下降。
再次，明神宗希望大权独揽，而又放任缺官不补，使得内阁势力被削弱；司礼监因拥有“批红”的权利，在这种特殊的情况下地位自然会有所上升；因明神宗对郑贵妃的宠爱，此时外戚的地位也得到了发展，而且出现内监以郑贵妃为内主的情况。此时言官因对朝政的不满争相上疏，对时政进行抨击，他们实力得到提高。
在朝臣和明神宗长达数十年的斗争过程中，言官这一重要力量以群体性的行动在维护正统皇位继承原则方面发挥了极为重要作用。在一定程度上，加剧了党争形成，为一己私欲牺牲国家大义的事例增多，最终导致政府机构涣散。
“国本之争”，决定了万历以后清末农民战争爆发，是晚清最具影响事件之一。这场冲突引发了一系列连锁反应，不仅加速了中国封建社会走向灭亡，也促进了中国政治格局的大幅调整。在后来的岁月里，这段历史被不断探讨，并且成为学者们研究晚期封建社会动态变化的一个关键领域。
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