在探索世界上最恐怖的朝代时，我们不可忽视明朝的都司卫所，这个充满权力与恐惧的人物机构。它是明太祖洪武初年建立的，最初名为都司和行都卫，后来在洪武八年改为都指挥使司和行都指挥使司。在宣德年间，它们逐渐固定下来。
明朝全国共有十六个都司和五个行都司，每一个布政使辖区内设有一处，都直隶于京师五军都督府。这些机构负责统辖各地的卫所，是地方最高军事长官。
山东、浙江、江西、福建、湖广等十三个省份下设有相应的地理区域作为其治所。而大宁、大宁留守、中兴留守等特殊地区则拥有独立的地理辖区。大宁原本位于今天的河北长城以北和辽宁西拉木伦河以南地区，但永乐元年被迁至保定府。另一些如陕西行都是在甘州卫，山西行都是在大同府，而福建行是在建宁府。
除了这些建立固定的行政区域，还有一些留守司专门负责皇陵的安全，如安徽凤阳设置中都留守司，以及湖广承天府设置兴都留守 司，他们分别管理凤阳八卫以及显陵二卫，并且由特定的官员担任监护人。
此外，还有屯田千户所，它们主要从事农牧活动，与普通百姓融合，被称作实土卫所。而那些不涉及民政，只专注于军事任务的小型组织，则被称作无实土衛所。这两种类型各自扮演着不同的角色，其中实土更接近当地社会生活，而无实土则更偏向纯粹的军事功能。
随着时间推移，这些组织结构经历了多次变动，有时候会根据需要调遣将领出征，有时候又会参与到地方管理中去，以确保士兵能够获得食物并进行训练。此外，由于边境地区屯田制度逐渐废弛，加之国家对士兵生活条件要求提高，许多战略防御基地也开始承担起一定程度的地方行政职能，最终导致了系统性的变化，使得原先严格划分开来的军事与民政职能变得难以分割。
这种制度虽然设计得完善，但由于后续政策调整以及屯田制度废弛，最终未能达到预期效果，在明末时期这些曾经强大的机构却因缺乏有效执行而失去了战斗力，从而无法有效维护国家安全或抵御外敌入侵。
