政治腐败与中央集权的松弛
随着时间的推移，明朝从朱元璋开创之初严格而高效的地方行政制度渐渐退化。万历年间（1573-1600），虽然明神宗在位期间努力恢复和巩固君主专制，但他的统治却逐渐陷入了腐败和无为政。官员们为了获取更多利益，不断地贪污腐败，而中央政府对于地方官吏的监督力度大减，使得地方行政变得更加混乱。在此背景下，地方势力的崛起成为一种常态。
经济困难与财政赤字
随着人口增加、农业发展以及对外战争等因素，国家税收负担加重，同时由于军事开支巨大，尤其是针对满族部落边境防御所需花费大量金钱，这些都导致了国家财政状况不断恶化。在万历年间，由于多次抗击蒙古和日本侵扰，以及内部战乱如太平岭之役、李自成之乱等耗费巨资，加上农民起义浪潮中各方争夺土地资源导致土地价格上涨，从而进一步加剧了国库空虚的问题。
农业生产问题与社会矛盾激化
万历年间中国南北气候异常频发，对农业生产造成了极大的影响。连绵不绝的地震、大旱、小麦病虫害等自然灾害使得粮食产量大幅下降，并且这些自然灾害还引发了一系列社会矛盾，如农民失去土地、流离失所者增多，最终形成了强烈的人口迁徙现象。同时，以天启七月十日事件为标志的一系列反封建斗争也在这个时期开始显露头角，他们以“土司”、“土豪”、“劣儒”为目标进行斗争，有力地挑战了封建统治秩序。
文化思想界的分裂与动荡
文化思想界也是一个分裂动荡的情况出现。这一时期，不仅存在学术上的不同的派别，如理学、名实学等，而且还有许多新兴宗教信仰如道教、三教合一运动影响深远。此外，还有文学作品中的讽刺批评政治现实，如汤显祖《牡丹亭》、《邯郸记》，以及其他文人墨客通过诗词歌赋表达对社会现状不满的情绪，都体现出当时文化思想界内外交融合和冲突演变的情况。
外患威胁与民族危机
最后，在国际关系方面，由于接连不断发生重大战争，如抗击日本水军、抵御蒙古侵犯及后来的清兵入关，这些长期以来未能彻底解决的问题，对国家安全构成了持续性的威胁。当时许多地区已经受到敌人的侵扰，一些重要城市甚至被迫接受投降条件或支付重税，而这些损失都是无法弥补的，它们削弱了国家力量，使得整个帝国面临着前所未有的民族危机。
