南明时期，随着清军的不断推进，许多地方官员和士族纷纷组织起自卫队或小型割据势力，以抵抗清军的统治。这些小朝廷大多规模较小，但在当地却有着相当的影响力。
如广西的桂王朱由榔，他在南明中期依靠地方势力的支持，一度控制了广西、湖南一带。虽然他最终于1650年被清军击败并自杀，但他的活动对于维护南明政权至关重要。
另一个著名的小朝廷是福建的郑成功，他虽然后来建立了东宁国，但是早期他也曾短暂地独立于南明之外，在台湾与海上地区进行反清斗争。他不仅保护了汉人，还吸引了一批流亡到台湾的知识分子和手工艺人，对台湾文化产生深远影响。
在江苏省域内，孙传庭等人的杭州剿匪运动也可以看作是一种小型割据行为，他们利用对抗土匪的手段来巩固自己的政治基础，并试图扩张到更大的区域。
最后，需要提到的还有山西边陲的一些少数民族领袖，他们由于自身的地理位置和部落联盟关系，与主体政权保持一定程度上的独立性。在这种背景下，他们有时会参与或者提供支援给其他割据势力，以保障自己的安全与利益。
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