兵疲将馁的根源：军队长期征战而未能获得充分的休息和补给，导致士气低落、战斗力下降。
在明朝中叶以后，由于连年战争和防御战役的不断进行，国库空虚，无法提供足够的物资来支持大规模军事行动。同时，由于中央集权制度下的官僚体系效率低下，物资调配、粮食供应等问题常常出现滞后或腐败现象，这些都加剧了兵力的疲惫。
将领无能带来的影响：由于选拔制度中的贪污腐败，以及对人才缺乏有效利用，使得真正有能力的将领无法得到发挥其才能的机会，而是让那些靠关系或者财富起家的无才之辈担任重要职位。
这类将领往往缺乏实际作战经验，更没有深厚的地缘政治知识，他们在关键时刻往往做出错误判断，从而影响到整个军事指挥系统。这种情况使得明朝军队在面对外部威胁时，无力应对，也难以形成有效抵抗敌人的力量。
军费开支与民生保障之间矛盾：为了维持庞大的帝国防御体系所需的大量金钱，在明朝晚期被大量用于购买武器装备和支付官员俸禄，但却忽视了民众生活水平提升，这直接导致了社会矛盾激化。
随着时间推移，这种状况逐渐恶化，最终导致国家内部失去稳定性。虽然短期内可以通过压迫农民增加税收来弥补赤字，但这种政策最终会引发更严重的问题，如农民起义等。这也是为什么说“过度征税”、“徭役繁重”是造成清初农民大起义的一个重要原因。
官僚体制中的漏洞与腐败：由朱元璋设立的一系列中央集权制度，如科举考试选拔官员机制，并非完全有效。在这个过程中，不少人依赖家族背景或者私交获取高位，而不是根据个人能力或成就。这样一来，就产生了一批既不懂治国也不懂用兵的人成为高级官员。
这些官员通常只关注如何保持自己的地位和利益，而不是考虑国家整体利益，因此他们对于处理复杂且需要多方面智慧的问题如边疆安全、经济管理等缺乏有效解决方案。而当遇到紧急情况时，他们又因为缺乏实际经验而不知如何是好。
经济衰退与资源枯竭：由于长时间战争消耗以及国内自然灾害频发，加上农业生产技术落后，经济一直处于一种微妙平衡状态。一旦遭遇突发事件，比如天灾人祸，那么原本脆弱的经济结构就会迅速崩溃。此外，由于人口增多土地有限，加上农业技术发展缓慢，使得产出不能满足需求，从而加剧了社会矛盾，为动荡局势埋下伏笔。
