元朝晚期的政治腐败与军事衰弱
元朝灭亡的原因中，政治腐败和军事衰弱是主要的两个方面。从朱元璋篡夺大位开始，元朝就逐渐走向了衰落。朱元璋通过削弱地方割据势力、建立中央集权制度来巩固自己的统治，但他也因此导致了官僚体系的膨胀和腐败问题的加剧。官员们为了获取更多利益，不断地贪污舞弊，这严重损害了国家的财政收入，也削弱了国家对外部威胁应对能力。
社会矛盾激化与民族关系紧张
在政治上出现问题同时，社会矛盾也在不断激化。在农民被迫承担更重的税赋压力下，他们反抗政府的一系列起义层出不穷。而且，由于长期内战和战争带来的破坏，加之人口减少等因素，使得农业生产陷入困境。这不仅影响到农民生活水平，还加剧了社会动荡。
外患日增与边疆防御难题
元朝时期，蒙古帝国虽然已被分裂为四个汗国，但其余三个汗国——察合台汗国、伊儿汗国及阿勒坦哈那（即瓦萨姆哈）仍然对中国有着潜在威胁。而且，在东北地区，以土蛮为代表的地方势力频繁发动攻击，对内迁移政策造成极大的挑战。此外，从1357年开始，一连串自然灾害如旱灾、洪水等进一步削弱了国家经济基础，使得防御能力大幅下降。
经济危机与货币贬值
随着战争和饥荒不断发生，整个社会经济进入了一种深刻危机状态。由于缺乏足够的人口进行劳作，以及资源短缺，大量土地闲置，而大量人口则流离失所或转而成为流民。这导致物价飞涨，同时由于金银严重流失，即便是金属货币也无法有效解决支付问题，最终形成了一种虚拟货币系统以应付日常需要，这样的经济状况对于稳定国家运作是不利的。
文化交流断绝与知识产学者流散
最后一条线索是文化交流断绝引发知识产学者流散。在历史上，无论哪个王朝，它们都依赖于高级知识份子来管理和维护其帝国。但到了明初，因为各种原因，如强制性的考试制度改变以及个人信仰观念不同等，这些人才纷纷离开或者隐居起来，其后果是没有这些人士支持的情况下，一时间很难找到能够处理复杂行政事务的人才，再加上当时科技水平低迷，更增加了这个时代末年的混乱程度。
