清顺治七年，明降将孔有德领兵攻陷桂林，改靖江王府为定南王府。顺治九年，农民起义军李定国攻占桂林，孔有德兵败，举火。图为靖江王府。
袁崇焕对不听调度的毛文龙终于忍无可忍，一怒之下先斩后奏把他杀了，这消息传出一片哗然。而崇祯皇帝却作出了超乎所有人想象的回应——表扬了袁崇焕。这是个什么信号？袁崇焕诛杀毛文龙的后遗症到底有多大？他有多少是私心？他到底错在哪儿了？
当尚方宝剑遭遇尚方宝剑
让 袁崇焕真正起了杀心的是毛文龙割据东江，不听调度。
要知道，毛文龙是明朝任命的东江总兵，他天启三年加封左都督，被赐尚方宝剑。他的桀骜不驯、拥兵自重、不服节制，都与袁崇焕的平辽方略格格不入。一上任，就宁远、锦州、蓟州各处军事要地都曾发生兵变，要整饬军纪，对于解决这个“独立王国”，即使手握重兵又孤悬海外，也不能容忍。
而作为封疆大吏手握重兵，又孤悬海外，毛文龙俨然就是个“土皇帝”，又怎么能甘心受袁崇焕的辖制和摆布呢？
据李清《袁督师斩杀毛文龙始末》记载，在五月二十九日，袁崇焕抵达东江所属岛屿，并致书毛文龍前来一会。随后带领三千名亲信将士赴会。当初见面气氛还算融洽，但当话题转入设饷宁远、更定营制、增设监司等具体问题时，却断然拒绝表示不接受任何整顿建议。
同样拿着皇帝赐的尚方宝剑，说一不二的人物，当这样的抗命者出现于部下中间，有谁能容忍呢！于是 袁崇焕动了真意，为了一举除掉这股异己力量，用尽各种手段，最终设计出一个局，让双方在“校射领赏”活动中相遇，将事情发展到紧要关头，然后突然围住并捕捉到了毫无防备的情形，将其斩首。这一切都是为了确保自己的权力和影响力的巩固，而不是仅仅为了削弱敌人的力量。
然而，这种行为引发了一连串复杂且危险的情况。在没有得到皇帝允许的情况下擅自行事，不但打乱了既定的计划，还引起了朝廷内部严重的问题。不久之后，当北边局势紧张时，其结果证明这种个人行动造成的问题比解决问题本身更加严峻，因为它破坏了一种协调统一，是一种非常危险的情景，是一种极端错误的心理状态，即便是在最紧急的时候也应该避免采取此类行动，以免导致更多混乱和损失。
关于这一点，有两种截然不同的看法：一种认为 毛 文 龙该被消除；另一种则认为他被误解或过分评价。他究竟该死还是该活，从历史角度看是一个复杂而深刻的问题，每个人的答案都会根据他们对那段历史背景以及人物性格特征持不同意见。但从战略层面上讲，无疑他的存在对于稳定局势至关重要，他牵制着后金的一些战略动向，因此，如果没有充分证据证明他的叛逆或者背叛行为，那么用生命去惩罚一个人似乎太过武断且可能带来不可预知的负面影响。此外，由于整个事件反映出的是一个高度个人化决策过程，而非经过广泛讨论和谨慎考虑后的决定，因此我们必须谨慎评估这些选择是否符合公正标准，以及它们所产生的一系列长期后果如何影响社会稳定与国家安全。
