在中国历史的长河中，各个朝代间相继更迭，其间产生了许多复杂而又深刻的社会政治现象。尤其是在明朝与清朝之间，这两个时代的交替过程显得尤为重要。因为这一段时间内，不仅是政权更替，更是文化、经济、军事等方面的一次大变革。而在这一过程中，元代作为一个跨越了13世纪至14世纪的大型帝国，其遗留下来的领土分配问题，也成为了当时的一个重大课题。
首先，我们需要了解元朝的领土状况。在忽必烈统治期间，元朝达到鼎盛时期，其版图辽阔无垠，从东起海洋西至波斯高原，从北达俄罗斯南至印度次大陆。这种广泛的疆域，使得后来继承这片土地上的不同民族和国家面临着如何合理划分和管理这些地域的问题。
明初朱元璋即位后，对于前任统治者的政策进行了一系列改革。他对之前蒙古族人占据的地盘进行重新划定，并且实行“户籍制度”，要求所有居民都必须注册并居住在指定的地方。这一制度虽然有助于巩固中央集权，但也导致了地界不再随着人口流动而变化，而是固定下来，以此限制人们自由迁移。此外，由于朱元璋对于蒙古族人的猜忌，他还实行了一系列排斥性措施，如禁止使用蒙古语、禁止穿戴蒙古服饰等，这些措施加剧了与 蒙古族以及其他少数民族之间的矛盾。
到了清初努尔哈赤建立满洲贵族统治下的清王朝，他利用自己的军事优势逐步扩张领土，并最终取代明末乱局中的各路割据势力，一举成为新的中央政府。在这个过程中，他采取了一种比较灵活的人口政策，即允许汉人和满洲贵族混合居住，同时鼓励他们共同发展经济，为的是增强新生的国家凝聚力并促进多民族共存。但同时，由于这种融合带来了文化冲突和身份认同问题，加之历史上存在过频繁易主的情况，使得关于边界争议及领土归属的问题依然存在。
在这样的背景下，当明、清两大王朝交接时期发生，“三藩”（李自成、孙传庭、何应钦）等反抗力量崛起，他们试图恢复或建立自己的事业。这意味着大量地区失去了有效控制，让原本就已经复杂的情形变得更加混乱。此外，由于当时国内外环境错综复杂，以及各种内部矛盾积累到一定程度，最终导致1644年顺天府（今北京）的陷落，即使如此，对比以往那样频繁变换政权的情况来说，此次政权更替相对较为平稳，因此能够有一定的时间去处理一些遗留的问题，比如前述提到的领土分配问题。
总结来说，在从元到明，再到清三个帝国之间转换的关键阶段，其中涉及到的“边界争议及领土归属”的问题，是由多方面因素综合作用所造成。而每个时代都有其独特的手法去解决这些难题，有时候通过行政手段调整，有时候则通过战争征服实现。不过，无论何种方式，它们都是中国历史长河中不可或缺的一部分，是我们今天研究史学者们不断探索的话题之一。
