国本之争的深远影响：明朝那些事儿中的皇权下降与社会反响
国本之争不仅对万历时期产生了重大影响，首先是导致了明神宗实际上失去政权。神宗不理朝政，对内阁和地方官员缺乏任用，极大地破坏了晚明的正常运作。而他又大兴敛财措施，派遣矿监和税监给百姓带来苦难，从而激发民变。这一点直接加剧了社会动荡。
其次，这场争论还促成了晚明党争的一个重要因素。由于神宗对储位问题的模糊态度，使得官员们猜忌对方，一片混乱。在这样的背景下形成了宣、昆、齐、楚、浙五党和东林两大派之间的公开斗争。此后，东林与阉党之间也爆发冲突，这种一方以私利牺牲国家的大义，不仅使政府效率低下，而且成为三大案之一的导火线。
再者，神宗希望独揽大权，但却放任缺职未补，让内阁力量受损；长时间居住在深宫中不理朝政，使司礼监的地位得到提升；同时，由于对郑贵妃宠爱过度，她身边的人也获得实力增长，并出现内监以郑贵妃为主的情况。
在这期间，因皇帝怠忽政务、廷臣相互攻讦及政府机构衰败，加上言官因为对时局不满而频繁上疏批评，此时他们的力量得到增强；地方上的仕途标准也不再是衡量人生的唯一标准，“山人”群体出现，并最终有东林书院文人关注时局称呼为“东林”，民变不断发生直至后金崛起代表着地方势力的崛起。
在数十年的斗争中，言官作为一个关键力量，以集体行动维护正统继承原则、稳定秩序并制衡皇权，以及弘扬正气，都发挥出了极其重要作用。“国本之争”，决定了万历之后清晰可见的是明朝走向何方，是造成晚明三大案以及加剧党争形成的一部分，也加速了一些事件推进到灭亡，有说法认为它是历史上最具影响的一次事件。
关于国本之争这一主题，还存在许多不同观点，其中包括一些史学家对于郑皇贵妃评价不足或负面，而这些评价往往基于一种僵化保守思想，没有公允性，无疑将已经分清是非的历史再次蒙上了迷雾。
