任何一个朝代的灭亡，原因无外乎天灾人祸，明末的天灾小冰河期谁都知道不用说，人祸一方面是鞑子，但是鞑子只是外因表象，不起决定性作用，外因通过内因起作用，内因是什么?一切原因归根结底还是人——官员。整体无能至极的官员，其无能不光体现在鞑子的那几场关键战争上。
首先，我们要谈谈财政问题。在历代大一统的封建王朝中，最重要的收入是什么？答案是盐税，这是国家垄断的一项暴利。盐税收入在清朝和两朝都占到了三分之一以上，而明朝的情况则不同，它们盐价远高于前两朝，但盐税收入连前两朝零头都没有。这主要是因为流失了大量的盐税催生了一大批富可敌国的盐商，所以这也归咎于官员的问题。
其次，我们来看藩王问题。当万历年间，有20多万宗室，他们国家财政收入全部加起来都不够发这些宗室寄生虫应付的一半。而且，还有许多士绅也不交税。这本身就显示出明朝开国时缺乏长远规划和文化素养。朱元璋这个土鳖根本就不可能制定有效政策治理国家，这种不足注定了后来的结果，比如藩王之乱、推恩令等问题。
再者，我们可以看到朱元璋自鸣得意卫所制度实际上是一种低效率管理方式，与唐朝府兵制相比更显劣势。这些都反映出朱元璋手下臣子的能力不足。此外建文帝削藩导致朱棣夺位，也说明了当时缺乏像样的领导人才。
教育系统也是一个重要的问题，从科举兴盛以后，只有儒家学术被强调，而科学与新思想发展受阻。在这个过程中，由于思维僵化，大部分时候中国已经无法从根本上解决问题，如同断绝新学科、新自然科学出现和发展的大门。此前的历史，如唐、宋、金、元期间，一直到清，都存在这种情况。
最后，要从根源来分析，那么百家争鸣时代缺少启蒙者这一点就是中华文明的一个遗憾。百家争鸣中的每个派别都是研究如何治人的法子，而并非真正意义上的理性思维探索，从头到尾连基本符号甚至数学概念都没有产生过不是没有原因的。这一切都是由于缺乏启蒙思想家的影响而造成的一个结果。
