国本之争的深远影响：从明神宗的怠政到晚明社会的动荡
国本之争对万历时期产生了持久且广泛的影响，首先体现在皇权实力的下降。明神宗长时间不理朝政，让内阁和地方官员缺位，这导致了国家管理出现严重问题，破坏了晚明正常运作。而他又通过敛财的手段，如派遣矿监、税监，对百姓造成极大伤害，最终激发民变。
其次，这场争议是促使党派斗争兴起的一个重要因素。由于明神宗对储位未有清晰态度，使得官僚和地方上的势力开始猜忌，政治局势混乱，不断出现宣、昆、齐、楚、浙五党和东林两大党派之间的公开与暗斗。这不仅加剧了政府效率低下的现象，也成为后来的三大案之一的导火索。
再者，明神宗希望掌握绝对权力，同时放任缺位，从而削弱了内阁势力；他长时间居住在深宫中不理朝事，使司礼监的地位得以提升；郑贵妃所受宠爱也使外戚力量增强，并出现内监由郑贵妃主导的情况。
皇帝荒唐无道，加上廷臣间的攻讦与诽谤，中央政府机构变得松散。在这种情况下言官因为对朝政不满，上疏批评时政，他们的地位也随之提高。此外，在地方上仕途不再是衡量人生价值唯一标准，“山人”群体逐渐形成，而文人关注时事最终演变成东林书院，其成员被称为东林党。万历末年的民变以及后金入侵，也反映出地方势力的崛起。
在这场持续数十年的政治斗争中，言官作为一个关键力量，以集体行动维护正统继承原则、稳定秩序并制衡皇权，以及弘扬正义气息发挥着至关重要作用。国本之争决定了万历之后 明朝走向，并在一定程度上加剧了党派冲突甚至加速了帝国灭亡，是晚明最具影响力的事件之一。
关于国本之争，有些历史研究者仍然站在一方，即认为应该站在万历一朝臣子这一边，对于此类主题存在大量观点分歧。在这个背景下，有些观点似乎将郑贵妃视为天生的祸水，不应有做皇后的野心，而对于王恭妃与万历皇帝的情感，只能接受他们恩爱互相依偎，却无法理解真正的情感交流。这类偏见常常源自一种固化保守的人云亦云思想，无疑是不公平且过分地扭曲历史真相，将原本已经模糊难辨的事实再次蒙上了厚重的沉积层。
